| № | レッドリスト カテゴリー区分 |
目 名 | 科 名 | 和 名 | 学 名 |
| 1 | 絶滅（EX） | コイ | コイ |  ゼニタナゴ |
Acheilognathus typus |
| 2 | 絶滅危惧Ⅰ類 （EN） |
トゲウオ | トゲウオ | ニホンイトヨ | Gasterosteus nipponicus |
| 3 | トゲウオ | トゲウオ | トミヨ属淡水型 | Pungitius pungitius | |
| 4 | スズキ | ハゼ | コシノハゼ | Gymnogobius nakamurae | |
| 5 | スズキ | ハゼ | クロヨシノボリ | Rhinogobius brunneus | |
| 6 | 絶滅危惧Ⅱ類 （VU） |
ヤツメウナギ | ヤツメウナギ | カワヤツメ | Lethenteron camtschaticum |
| 7 | ウナギ | ウナギ | ニホンウナギ | Anguilla japonica | |
| 8 | コイ | コイ | キタノアカヒレタビラ | Acheilognathus tabira tohokuensis | |
| 9 | コイ | コイ | ジュウサンウグイ | Tribolodon brandtii brandtii | |
| 10 | コイ | コイ | ウケクチウグイ | Tribolodon nakamurai | |
| 11 | コイ | コイ | エゾウグイ | Tribolodon sachalinensis | |
| 12 | コイ | コイ | シナイモツゴ | Pseudorasbora pumila pumila | |
| 13 | コイ | ドジョウ | ホトケドジョウ | Lefua echigonia | |
| 14 | スズキ | カジカ | カンキョウカジカ | Cottus hangiongensis | |
| 15 | スズキ | カジカ | カジカ中卵型 | Cottus sp. | |
| 16 | スズキ | ハゼ | シロウオ | Leucopsarion petersii | |
| 17 | スズキ | ハゼ | ビリンゴ | Gymnogobius breunigii | |
| 18 | スズキ | ハゼ | ジュズカケハゼ | Gymnogobius castaneus | |
| 19 | 準絶滅危惧 （NT） |
ヤツメウナギ | ヤツメウナギ | スナヤツメ（北方種・南方種） | Lethenteron sp. N, Lethenteron sp. S |
| 20 | コイ | コイ | ヤリタナゴ | Tanakia lanceolata | |
| 21 | ナマズ | アカザ | アカザ | Liobagrus reinii | |
| 22 | サケ | キュウリウオ | ワカサギ | Hypomesus nipponensis | |
| 23 | サケ | サケ | ニッコウイワナ | Salvelinus leucomaenis pluvius | |
| 24 | サケ | サケ | サクラマス（ヤマメ） | Oncorhynchus masou masou | |
| 25 | ダツ | メダカ | キタノメダカ | Oryzias sakaizumii | |
| 26 | スズキ | カジカ | アユカケ(カマキリ） | Rheopresbe kazika | |
| 27 | スズキ | カジカ | カジカ大卵型 | Cottus pollux | |
| 28 | 地域個体群 （LP） |
スズキ | カジカ | ハナカジカ | Cottus nozawae |
| 29 | スズキ | ハゼ | イドミミズハゼ | Luciogobius pallidus | |
| 30 | スズキ | ハゼ | チチブ | Tridentiger obscurus | |
| 31 | スズキ | ハゼ | ゴクラクハゼ | Rhinogobius giurinus | |
| 32 | スズキ | ハゼ | ウロハゼ | Glossogobius olivaceus | |
| 33 | スズキ | ハゼ | アベハゼ | Mugilogobius abei | |
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